由于存在体制性缺陷，客观上无法保证变革中的金融主体在市场运行中享有同等的利益分配权、资源配置权和充分的经营自主权、自我保护权。以金融主体最必需的交易平等权、信息知情权、资产所有权、经营自主权、法人治理权和债务维护权为例，在权力不对等作用下，引发金融风险的可能性极大。从金融权力均衡对等角度考虑，为有效遏制风险蔓延，必须从源头上把住风险入口，并将滞留于金融内部的风险成功疏导至金融体外。

中国资本市场的系统风险根源于市场的结构矛盾特别是股票市场的结构矛盾，这些矛盾主要体现在股权割裂、博弈格局的变化和当前交易机制下的投资者结构的变动，前两者是诱发投资者信心崩溃和阻碍信心恢复的核心因素，而市场机制的完善是维持市场信心的外在保障。在可预见的期限内如果中国资本市场出现系统风险，它最有可能从股票市场最先出现，危及从股票市场向其它市场的扩散过程中，以证券公司为主的机构投资者的资产结构调整将起到重要的作用。要预防中国资本市场系统性风险出现首先要解决股票市场的结构矛盾，首要的就是尽快采取行动，不能使问题越积越大，在完善市场制度建设的同时，着手解决股权割裂问题，只有这样，才能为以股票市场为核心的中国资本市场健康发展奠定基础。